|
|
Pokročilé metody detekce kontury srdečních buněk
Spíchalová, Barbora ; Čmiel, Vratislav (oponent) ; Odstrčilík, Jan (vedoucí práce)
Tato diplomová práce se zabývá pokročilými metodami detekce kontur srdečních buněk a měření jejich kontrakce. V úvodní teoretické části práce jsou popsány druhy konfokálních mikroskopů, které se používají pro snímání biologických vzorků. Následuje kapitola věnovaná metodám segmentace srdečních buněk, kde jsme seznámeni s běžně užívanými přístupy. Nejpoužívanější metody segmentace jsou aktivní kontury a matematická morfologie, kterým se věnuje podstatná část práce a blíže nás s těmito přístupy seznamuje. Díky těmto metodám jsme schopni v obrazových datech přesně detekovat požadované prvky a měřit jejich změnu plochy v čase. Nabyté teoretické znalosti nám slouží pro praktickou realizaci metod v programovém prostředí MATLAB.
|
|
| |
|
| |
|
|
Pokročilé metody detekce kontury srdečních buněk
Spíchalová, Barbora ; Čmiel, Vratislav (oponent) ; Odstrčilík, Jan (vedoucí práce)
Tato diplomová práce se zabývá pokročilými metodami detekce kontur srdečních buněk a měření jejich kontrakce. V úvodní teoretické části práce jsou popsány druhy konfokálních mikroskopů, které se používají pro snímání biologických vzorků. Následuje kapitola věnovaná metodám segmentace srdečních buněk, kde jsme seznámeni s běžně užívanými přístupy. Nejpoužívanější metody segmentace jsou aktivní kontury a matematická morfologie, kterým se věnuje podstatná část práce a blíže nás s těmito přístupy seznamuje. Díky těmto metodám jsme schopni v obrazových datech přesně detekovat požadované prvky a měřit jejich změnu plochy v čase. Nabyté teoretické znalosti nám slouží pro praktickou realizaci metod v programovém prostředí MATLAB.
|
|
| |
|
|
Physiological consequences of ion concentration changes in transverse-axial tubular system in a model of human ventricular cardiomyocyte
Ohlidalova, D. ; Pásek, Michal ; Šimurda, J. ; Christé, G.
A mathematical model of human ventricular cell incorporating the transverse axial tubular system (TATS) was designed and used to explore the role of TATS in human ventricular cell electrophysiological activity. The model is based on the latest quantitative description of guinea pig ventricular cell electrophysiology and modified to respect the published data obtained from human cardiac preparations. Computer simulations suggest that significant transient depletions of Ca2+ ions and accumulation of K+ ions may occur in the human TATS. The preliminary analysis of the effects of tubular Ca2+depletions on the activity of the model cell indicates their role in limitation of intracellular Ca2+ overload at higher frequencies of stimulation.
|
|
| |
|
| |
|
|
Quantitative modelling of effect of transverse - axial tubular system on electrical activity of cardiac cells: Development of model II
Pásek, Michal ; Christé, G. ; Šimurda, J.
In this work, we present a new version of cardiac ventricular cell model incorporating the transverse - axial tubular system. The improvements include reformulated description of L-type Ca2+ channel, of Ca2+ induced Ca2+ release from sarcoplasmic reticulum, of intracellular Ca2+ buffering and incorporation of potassium currents Ito, IK(Na) and IK(ATP). In comparison with the previous model (Pásek et al., 2002), the steady state simulations revealed more profound changes of tubular ionic concentration (12.8 % for Ca2+ and 4.7 % for K+ at 1 Hz). The refined model will be used for more exact quantitative exploration of the effect of transverse - axial tubular system on cellular electrical activity and excitation - contraction coupling.
|
|
| |
host ::
RSS.